Молодой человек стоит на коленях на скалистом выступе, его руки связаны за деревом, его тело пронзено стрелами, а взгляд устремлен вверх в жесте страдания и духовной стойкости. Удлиненные конечности фигуры и драматическое освещение усиливают чувство напряжения и драмы, в то время как пейзаж за его спиной уходит в бурное небо. Мученичество святого Себастьяна изображает легендарные испытания святого под властью Диоклетиана, когда его связали и стреляли в него стрелами за его христианскую веру, что является популярной темой в религиозном искусстве.

Ученые датируют эту работу примерно 1577 годом, помещая ее в начало карьеры Эль Греко в Испании, и некоторые связывают ее заказ с Диего де Кастилья, хотя другие предполагают, что она впервые принадлежала Дон Хуану Алонсо де Кордоба, соратнику епископа Паленсии. Уникальная поза на коленях в картине необычна для изображений святого Себастьяна и может отражать вовлеченность Эль Греко в композиции более ранних мастеров. Созданная в ранний испанский период художника, эта работа находится на пересечении Маньеризма и личного стиля, который определит поздние религиозные картины Эль Греко.