Ein junger Mann kniet auf einem felsigen Vorsprung, seine Arme hinter einem Baum gebunden, sein Körper von Pfeilen durchbohrt und sein Blick nach oben gerichtet in einer Geste des Leidens und der spirituellen Ausdauer. Die elongated Gliedmaßen der Figur und das dramatische Licht verstärken das Gefühl von Spannung und Drama, während die Landschaft hinter ihm in einen stürmischen Himmel zurückweicht. Das Martyrium des heiligen Sebastian zeigt die legendäre Prüfung des Heiligen unter Diokletian, als er für seinen christlichen Glauben gefesselt und mit Pfeilen beschossen wurde, ein beliebtes Thema in der religiösen Kunst.

Wissenschaftler datieren das Werk auf etwa 1577 und platzieren es zu Beginn der Karriere von El Greco in Spanien; einige haben seinen Auftrag Diego de Castilla zugeordnet, während andere vorschlagen, dass es zuerst Don Juan Alonso de Córdoba gehörte, einem Mitarbeiter des Bischofs von Palencia. Die markante kniende Pose des Gemäldes ist für Darstellungen des heiligen Sebastian ungewöhnlich und könnte El Grecos Auseinandersetzung mit den Kompositionen früherer Meister widerspiegeln. In der frühen spanischen Periode des Künstlers geschaffen, steht dieses Werk an der Schnittstelle zwischen Manierismus und dem persönlichen Stil, der die späteren religiösen Gemälde von El Greco definieren würde.