Ни один другой художник не возвращался так часто к одинокой фигуре Святого Франциска, как Эль Греко, создав более дюжины вариаций на протяжении своей карьеры. Это постоянное увлечение заставило ученых задуматься, не видел ли художник, родившийся как Доменикос Сеотокопулос, в святом зеркало своих собственных духовных исканий. Версия, написанная в 1590 году, выделяется своей интенсивностью и сдержанностью, убирая повествовательные детали, чтобы сосредоточиться на едином моменте внутреннего поклонения.

Происхождение работы до 19 века остается неясным, что добавляет тихую загадку, окружающую ее истоки. Святой Франциск стоит на коленях перед простым деревянным крестом, руки сложены в молитве, глаза подняты в молчаливом общении. Художник выбирает не драму получения стигматов, а тишину, которая следует за этим — паузу, полную тоски и благоговения. Грубая ряса Франциска изображена быстрыми, светящимися мазками, складки ловят потусторонний свет, падающий сверху.

Череп рядом с ним, как напоминание о смертности, заставляет зрителей задуматься о бренности жизни и отказе от земных вещей. В отличие от золотого спокойствия Джованни Беллини в Святом Франциске в пустыне, видение Эль Греко является резким, почти аскетичным, с вытянутыми формами и палитрой холодных, дымчатых серых тонов. Ранняя история картины неясна, что типично для многих работ Эль Греко из его толедского периода, когда он работал как для религиозных орденов, так и для частных покровителей. Хотя оригинальная комиссия неизвестна, интимные размеры картины предполагают, что она была предназначена для частного поклонения, а не для публичного показа.

На протяжении веков она переходила из рук в руки, иногда приписывалась помощникам мастерской или подражателям, прежде чем консенсус вернул ее к Эль Греко. Сегодня Святой Франциск в молитве перед крестом признан краеугольным камнем зрелого стиля художника, свидетельством его уникального сочетания венецианского цвета и испанского мистицизма.