No hay ningún documento que pruebe que el joven en este retrato sea realmente San Luis Gonzaga, sin embargo, durante siglos la tradición ha insistido en esta identificación. La incertidumbre ha llevado a debates animados entre los académicos, algunos de los cuales señalan los delicados rasgos y la expresión ascética del retratado como evidencia, mientras que otros destacan la falta de atributos explícitos. La atribución de la pintura a El Greco tampoco es universalmente aceptada, pero sus formas alargadas y la intensidad espiritual son características de su estilo.

Este aire de misterio solo ha aumentado el atractivo de la pintura, invitando a los espectadores a buscar pistas en cada pincelada. El joven mira hacia afuera con una suave melancolía, sus manos ligeramente entrelazadas en un gesto de humildad. Si este es de hecho San Luis, el artista ha optado por capturarlo no en los arrebatos del martirio o el éxtasis, sino en un momento de tranquila devoción. El oscuro fondo, casi tormentoso, resalta el rostro pálido, una técnica que El Greco usaba a menudo para sugerir la luz interior del sujeto.

A diferencia de las representaciones más ornamentadas de santos por Caravaggio, aquí no hay drama evidente, solo la tensión silenciosa entre la belleza terrenal y la resolución espiritual. La ausencia de símbolos evidentes, como el lirio o el crucifijo a menudo asociados con Luis, deja la identidad del retratado tentadoramente abierta. La historia temprana de la pintura sigue siendo oscura; no han aparecido registros de comisiones y su procedencia antes del siglo XIX no está documentada. Obras de este tipo—santos masculinos jóvenes o nobles, pintados a finales del siglo XVI—tenían una alta demanda entre los patronos españoles, ansiosos por exhibir tanto piedad como gusto.

Hoy en día, el retrato es valorado como un buen ejemplo de la pintura de retratos devocionales que floreció en el taller de El Greco en Toledo, ya sea que el retratado sea realmente el joven santo jesuita o no. Su viaje de manos privadas a la pared del museo ha dejado vacíos que quizás nunca se llenen, pero su presencia inquietante continúa inspirando curiosidad y debate.