엘 그레코의 그림 중 성 세바스티안의 순교만큼 많은 논란을 일으킨 작품은 드물다. 1610년경에 제작된 이 작품은 수세기 동안 학자들을 혼란스럽게 해왔다. 위임 기록은 남아 있지 않으며, 작품의 매체도 불확실하여 그 신비로운 분위기를 더하고 있다.

엘 그레코의 종교적 장면 중 대부분과는 달리, 이 성 세바스티안은 거의 독립적으로 존재한다. 예술가의 다른 묘사는 거의 알려져 있지 않으며, 일부는 이 작품이 그의 손에 의해 완성되었는지, 아니면 그의 작업실에 의해 완성되었는지 의문을 제기하기도 한다. 이 그림의 비정상적인 수직성과 성인의 늘어난 형태는 특정한, 현재는 잃어버린 건축적 환경을 위해 의도되었을 것이라는 추측을 불러일으킨다. 엘 그레코가 선택한 순간은 폭력 속에서의 섬뜩한 고요함이다.

나무에 묶인 성 세바스티안은 화살이 그의 살을 관통하는 가운데 하늘을 바라보고 있다. 그의 몸은 거의 불가능할 정도로 길게 늘어나 있으며, 지상의 고통에 도전하는 듯 보인다. 그의 위로 향한 얼굴과 빛나는 피부는 고통에서 시선을 돌리고 영적인 초월로 이끈다.

성 세바스티안의 몸통에 걸쳐지는 빛의 놀이와 비틀린 자세는 예술가의 인체에 대한 매력을 떠올리게 하지만, 여기서 성인의 고요함은 그의 상처만큼이나 두드러진다. 이전의 예술가들, 예를 들어 안드레아 만테냐의 성 세바스티안처럼, 순교의 잔혹성에 초점을 맞춘 반면, 엘 그레코는 내면의 우아함과 신앙의 비전을 제공하며, 대담한 색상과 극적인 대비를 사용하여 세속적인 고통에 대한 영적인 승리의 감각을 높인다. 성 세바스티안의 순교의 초기 역사에 대한 기록은 불분명하며, 최초의 소유자나 의도된 장소에 대한 기록은 남아 있지 않다. 일반적으로 이 작품은 엘 그레코의 생애 마지막 10년 동안 톨레도에서 그려진 것으로 여겨지며, 이 시기는 점점 더 표현적이고 개성 있는 작품들이 특징이다.

수세기 동안 이 그림은 개인 소장품을 거쳐 왔으며, 때때로 엘 그레코의 아들 호르헤 마누엘 세오토코풀리에게 부분적으로 귀속되기도 하여 그의 후반 작업실의 협력적인 성격을 반영하고 있다. 오늘날 이 그림은 17세기 초 엘 그레코의 독특한 비전을 증명하는 작품으로, 후기 르네상스와 초기 바로크 예술의 세계를 잇는 역할을 하고 있다.