Zu Beginn des 17. Jahrhunderts malte El Greco mehrere Visionen von Franz von Assisi, aber Franziskus' Vision der Flammenden Fackel sticht durch ihr seltenes und rätselhaftes Thema hervor. Im Gegensatz zu den vertrauteren Szenen, in denen der Heilige die Stigmata empfängt, ist hier Franziskus von einer brennenden Fackel gebannt — ein Motiv, das Gelehrte seit Jahrhunderten verwirrt.

Es gibt keine direkte Textquelle, die diese Vision beschreibt, und einige Kunsthistoriker haben spekuliert, dass sie eine persönliche Meditation von El Greco über spirituelle Erleuchtung widerspiegeln könnte. Die geheimnisvolle Ikonographie des Gemäldes inspiriert weiterhin Debatten: Ist die Fackel ein Symbol der göttlichen Liebe oder eine Anspielung auf Franziskus' eigenen feurigen Eifer? Der Moment, den El Greco einfängt, ist einer gebannten Aufmerksamkeit: Franziskus, in bescheidenem Braun gewandet, kniet in einer felsigen Landschaft, sein Blick auf die übernatürliche Flamme vor ihm gerichtet. Die Fackel, die von einem Engel emporgehalten oder auf wunderbare Weise schwebend ist, taucht Franziskus' Gesicht in ein überirdisches Licht und hebt ihn von der schattigen Erde ab.

Die Hände des Heiligen sind im Gebet gefaltet, und sein Gesichtsausdruck ist einer von Ehrfurcht und Hingabe, was auf eine private Offenbarung hindeutet. Dies unterscheidet sich deutlich von den dramatischen Wunden und himmlischen Heerscharen, die in Giottos berühmten Fresken von Franziskus zu sehen sind; El Greco isoliert stattdessen den Heiligen und die Flamme und konzentriert sich auf die einsame Begegnung zwischen menschlichem Verlangen und göttlichem Feuer. Die Provenienz von Franziskus' Vision der Flammenden Fackel ist nicht vollständig dokumentiert, gehört aber zu einer Gruppe von franziskanischen Themen, die El Greco während seiner reifen Jahre in Toledo um 1600 malte.

Diese Werke wurden wahrscheinlich von lokalen monastischen Mäzenen in Auftrag gegeben, was die tiefen franziskanischen Verbindungen der Stadt widerspiegelt. Im Laufe der Zeit ist das Gemälde durch verschiedene private und kirchliche Sammlungen gewandert, und sein Medium — ob Öl auf Leinwand oder auf Holz — bleibt aufgrund des Mangels an frühen Aufzeichnungen ungewiss. Heute wird es als ein markantes Beispiel für El Grecos späten Stil anerkannt, mit seinen elongated Formen und leuchtenden Farben, und steht als Zeugnis seiner Faszination für das innere Leben der Heiligen.