Peu de peintures de El Greco ont suscité autant de débats parmi les chercheurs que La Vierge et l'Enfant avec Sainte Anne. Bien que la commande exacte reste incertaine, l'œuvre est remarquable pour son sujet rare dans l'œuvre de l'artiste et pour l'existence d'au moins une autre version, maintenant au Museo del Prado. L'énergie tourbillonnante de la peinture et les figures allongées ont conduit certains à spéculer qu'elle était destinée à une dévotion privée plutôt qu'à une exposition publique.

Sa composition inhabituelle et l'interaction tendre, presque théâtrale, entre les figures en ont fait un point de référence pour les discussions sur le style mature de El Greco vers 1600. Au cœur de la scène, Sainte Anne, la mère de la Vierge Marie, est assise protectrice derrière sa fille et l'Enfant Christ. El Greco choisit un moment de contact intime : la main d'Anne repose doucement sur l'épaule de Marie, tandis que Marie se penche en avant, présentant l'enfant Jésus au spectateur. Le trio est enfermé dans une étreinte triangulaire, leurs formes allongées et leurs gestes expressifs étant typiques de la période tardive de El Greco.

Le drapé tourbillonnant et la lumière éthérée concentrent l'attention sur l'Enfant Christ, qui lève la main en bénédiction. Contrairement à la célèbre La Vierge et l'Enfant avec Sainte Anne de Léonard, qui met l'accent sur la complexité psychologique, la version de El Greco est entièrement axée sur l'immédiateté spirituelle et le lien mystique entre les générations. Le parcours de cette peinture à travers l'histoire n'est pas entièrement documenté, mais il est généralement admis qu'elle a été créée durant les années prolifiques de El Greco à Tolède, vers 1600. Son style reflète la manière tardive de l'artiste, lorsque ses figures sont devenues plus allongées et ses couleurs plus audacieuses.

La provenance de la peinture avant d'entrer dans le système muséal moderne est floue, un destin commun à de nombreuses œuvres de El Greco produites pour des mécènes locaux ou des institutions religieuses en Espagne. Aujourd'hui, La Vierge et l'Enfant avec Sainte Anne se dresse comme un témoignage de la vision unique de l'artiste, reliant la tradition byzantine et les sommets expressifs de la Renaissance espagnole.