Poche pitture di El Greco hanno suscitato tanto dibattito tra gli studiosi quanto La Vergine e il Bambino con Santa Anna. Sebbene la commissione esatta rimanga incerta, l'opera è notevole per il suo raro soggetto nell'opera dell'artista e per l'esistenza di almeno un'altra versione, ora al Museo del Prado. L'energia vorticosa della pittura e le figure allungate hanno portato alcuni a speculare che fosse destinata alla devozione privata piuttosto che all'esposizione pubblica.

La sua composizione insolita e l'interazione tenera, quasi teatrale, tra le figure l'hanno resa un punto di riferimento per le discussioni sullo stile maturo di El Greco intorno al 1600. Al centro della scena, Santa Anna, la madre della Vergine Maria, siede protettiva dietro sua figlia e il Bambino Cristo. El Greco sceglie un momento di contatto intimo: la mano di Anna riposa delicatamente sulla spalla di Maria, mentre Maria si inclina in avanti, presentando il bambino Gesù allo spettatore. Il trio è bloccato in un abbraccio triangolare, le loro forme allungate e i gesti espressivi tipici del periodo tardo di El Greco.

Il drappeggio vorticoso e la luce eterea concentrano l'attenzione sul Bambino Cristo, che alza la mano in benedizione. A differenza della famosa La Vergine e il Bambino con Santa Anna di Leonardo, che enfatizza la complessità psicologica, la versione di El Greco è tutta incentrata sull'immediatezza spirituale e sul legame mistico tra le generazioni. Il percorso di questo dipinto attraverso la storia non è completamente documentato, ma si concorda generalmente che sia stato creato durante gli anni prolifici di El Greco a Toledo, intorno al 1600. Il suo stile riflette il modo tardo dell'artista, quando le sue figure divennero più allungate e i suoi colori più audaci.

La provenienza del dipinto prima di entrare nel sistema museale moderno è poco chiara, un destino comune per molte opere di El Greco prodotte per mecenati locali o istituzioni religiose in Spagna. Oggi, La Vergine e il Bambino con Santa Anna si erge come un testimone della visione unica dell'artista, che unisce la tradizione bizantina e le altezze espressive del Rinascimento spagnolo.