Alla fine del XVI secolo, El Greco dipinse almeno tre versioni conosciute di San Francesco d'Assisi riceve gli stigmi, un soggetto che lo affascinò per tutta la sua carriera. Quest'opera particolare, realizzata nel 1575, è tra le più antiche, creata durante un periodo di transizione mentre l'artista si trasferiva da Venezia in Spagna. La ripetizione del tema suggerisce una profonda risonanza personale, così come una consapevolezza acuta della sua popolarità tra i mecenati religiosi della Controriforma.

Il mezzo incerto della pittura—probabilmente olio su tavola o tela—aggiunge uno strato di mistero, così come la mancanza di documentazione chiara riguardo al suo incarico originale. San Francesco, inginocchiato in una solitudine rocciosa, riceve le ferite miracolose di Cristo mentre un angelo serafico appare sopra di lui, irradiando luce divina. El Greco cattura il momento di estasi mistica: le mani di Francesco sono sollevate in ammirazione, il suo volto rivolto verso il cielo, mentre le ferite—gli stigmi—iniziano a fiorire sulla sua carne. Il paesaggio austero, spogliato di ornamenti, concentra lo sguardo sul dramma tra il santo e l'angelo.

Le forme allungate e vorticosi e i contrasti intensi di luce e ombra sono tratti distintivi dello stile di El Greco, già distinto dall'approccio più misurato di, ad esempio, i trattamenti precedenti di Giovanni Bellini sullo stesso miracolo, che enfatizzano la calma riverente rispetto al fervore spirituale. La provenienza iniziale di questo dipinto rimane incerta, sebbene probabilmente sia passata attraverso collezioni devozionali private prima di entrare nell'orbita di importanti mecenati spagnoli. Si trova sulla soglia del periodo maturo di El Greco, quando la sua visione unica emergerà pienamente a Toledo. Oggi, questa versione è spesso studiata per la sua sintesi di colore veneziano, forma manierista e mistica spagnola.

Sebbene il percorso esatto del dipinto non sia completamente tracciato, la sua sopravvivenza e lo studio continuo riflettono il potere duraturo sia del suo soggetto che dell'immaginazione inquieta del suo creatore.