Quando Sandro Botticelli dipinse La Trasfigurazione, San Girolamo e Sant'Agostino intorno al 1500, stava entrando negli ultimi anni della sua carriera, un periodo segnato da un crescente fervore religioso a Firenze e dall'influenza del fervente predicatore Savonarola. Quest'opera si distingue perché unisce tre figure monumentali: Cristo, San Girolamo e Sant'Agostino, che raramente condividono lo stesso spazio pittorico. La composizione e il soggetto della pittura hanno portato gli studiosi a speculare che fosse commissionata per un'istituzione religiosa erudita, forse un monastero o una confraternita dedicata allo studio e alla contemplazione, sebbene non esistano registrazioni definitive del suo patrono originale. Al centro della pittura, Cristo è mostrato nel momento della Trasfigurazione, la sua figura radiante ed elevata al di sopra del piano terreno, affiancata da Mosè ed Elia.

Sotto, San Girolamo, noto per la sua traduzione della Bibbia in latino, e Sant'Agostino, il filosofo-vescovo, sono ritratti in profonda contemplazione, i loro gesti e attributi—il leone di Girolamo e la mitra vescovile di Agostino—li identificano in modo inconfondibile. Il drammatico contrasto di luce, con Cristo avvolto nella brillantezza e i santi in parte in ombra, sottolinea la divisione tra rivelazione divina e comprensione umana. A differenza della successiva Trasfigurazione di Raffaello, che trabocca di movimento tumultuoso, la versione di Botticelli è caratterizzata da una gravità silenziosa, invitando lo spettatore a meditare sui misteri della fede e dell'intelletto. La storia fisica di La Trasfigurazione, San Girolamo e Sant'Agostino rimane in parte avvolta nel mistero, come spesso accade con le opere tarde di Botticelli.

Non è chiaro quando il dipinto abbia lasciato il suo contesto originale, ma nel diciannovesimo secolo faceva parte di una collezione privata in Italia, prima di entrare nella sfera pubblica attraverso l'acquisizione da parte di un importante museo. Oggi è riconosciuto come un testimone dello stile in evoluzione di Botticelli nei suoi ultimi anni, quando la sua tavolozza divenne più austera e le sue figure più introspettive. La combinazione di profondità teologica e sottigliezza psicologica del dipinto lo ha reso oggetto di studio continuo, soprattutto mentre gli studiosi continuano a rivalutare l'eredità di Botticelli oltre le sue celebri mitologie.