Ningún otro artista regresó tan a menudo a la figura de San Francisco como El Greco, y San Francisco de Asís en meditación es una de al menos una docena de versiones que pintó entre la década de 1580 y su muerte en 1614. La persistencia de este tema en su obra ha desconcertado a los historiadores: ¿fue una devoción personal, una respuesta al llamado de la Contrarreforma por modelos de piedad, o simplemente las demandas de los patronos franciscanos de Toledo? Cualquiera que sea la razón, cada versión es sutilmente diferente, y ninguna es idéntica, un testimonio de la imaginación inquieta de El Greco y la urgencia espiritual que encontró en la historia del santo. Aquí, El Greco captura a San Francisco en el apogeo de su contemplación mística, con las manos entrelazadas, los ojos alzados, la boca ligeramente entreabierta como si susurrara una oración. El áspero hábito del santo, la cuerda anudada y el cráneo a sus pies no son solo accesorios, sino símbolos: pobreza, mortalidad y la renuncia a las cosas mundanas.

La luz, que cae bruscamente desde arriba, aísla a Francisco contra un fondo tormentoso, atrayendo al espectador hacia el drama de su comunión solitaria con Dios. A diferencia de las representaciones calmadas y ordenadas de artistas anteriores como Zurbarán, el Francisco de El Greco es alargado, casi parpadeante, su forma resonando con la intensidad de su visión. Los orígenes precisos de este particular San Francisco de Asís en meditación siguen siendo inciertos, ya que la historia temprana de la pintura no está documentada y su medio es debatido: es probable que sea óleo sobre lienzo, pero no está confirmado. Se piensa que fue producido en Toledo alrededor de 1600, durante el período maduro del artista, cuando su estilo había alcanzado su forma más expresiva.

Hoy en día, la pintura es reconocida como un ejemplo clave de las obras religiosas tardías de El Greco, reflejando tanto su estilo personal como el clima espiritual de la España post-reformista. Su viaje desde el estudio del artista hasta su hogar actual es incierto, pero su presencia duradera en las colecciones de museos habla de su poder y de la fascinación que continúa inspirando.