Nenhum outro tema aparece com mais frequência nas mãos de El Greco do que São Francisco, e entre estes, suas versões de São Francisco Recebendo os Estigmas são especialmente numerosas, testemunho tanto da fascinação do artista quanto da fome espiritual de seus patronos. A história por trás dessas pinturas está enraizada em um evento milagroso que se diz ter ocorrido em 1224, quando Francisco de Assis, orando no Monte La Verna, recebeu feridas que refletiam as de Cristo. Embora a data exata e a comissão desta versão específica permaneçam incertas, sua existência entre muitas outras sinaliza o apelo duradouro da experiência mística de Francisco tanto para colecionadores espanhóis quanto para a devoção da Contra-Reforma. Nesta pintura, El Greco captura o exato instante em que a visão serafica perfura Francisco com os estigmas: o santo, magro e de olhos arregalados, se ajoelha em um deserto rochoso, com as mãos levantadas em admiração enquanto raios de luz sobrenatural descem sobre ele.

O hábito áspero, a corda atada e o crânio a seus pés evocam humildade e meditação sobre a mortalidade. O fundo se dissolve em uma tempestade de cores e pinceladas cintilantes, uma assinatura do estilo tardio de El Greco, que distingue sua visão dos tratamentos mais contidos de artistas como Giovanni Bellini. Aqui, o drama não está no detalhe narrativo, mas na intensidade espiritual, com a forma alongada de Francisco e seu rosto luminoso atraindo o espectador para o mistério. A história física desta pintura é elusiva; como muitas das obras de El Greco, provavelmente se originou em Toledo, onde o artista passou suas últimas décadas.

Sem um patrono documentado ou uma procedência precoce, ela se ergue como um exemplo das imagens devocionais que preencheram capelas espanholas e coleções privadas durante o final do século XVI e o início do XVII. Com o tempo, as atribuições das pinturas de São Francisco de El Greco mudaram, já que seu ateliê frequentemente produzia múltiplas versões para clientes ansiosos. Hoje, o lugar desta pintura na obra do artista está assegurado, refletindo tanto a demanda por imagens franciscanas quanto a visão única de El Greco, uma que continua a intrigar estudiosos e visitantes igualmente.