Quando El Greco arrivò in Spagna nel 1577, portò con sé uno stile che presto avrebbe inquietato e affascinato i suoi mecenati. Tra le prime e più intriganti commissioni dei suoi anni spagnoli c'è L'Immacolata Concezione con San Giovanni Evangelista, dipinta intorno al 1580. Quest'opera si distingue perché combina due potenti devozioni: la purezza immacolata di Maria e la testimonianza visionaria di San Giovanni, in una singola composizione vorticosa.

Pochi artisti prima di El Greco avevano osato fondere questi temi con tanta audacia, e l'iconografia insolita del dipinto ha suscitato dibattiti tra gli studiosi sul suo scopo originale. La scena cattura la Vergine Maria nel momento della sua Immacolata Concezione, che si eleva verso il cielo, con le mani giunte in umiltà, circondata da una schiera di angeli. Sotto di lei, San Giovanni Evangelista guarda verso l'alto, il suo libro aperto, come se stesse registrando una visione concessa solo a lui. La luna crescente sotto i piedi di Maria e la corona di stelle sopra la sua testa provengono direttamente dalla visione apocalittica nel Libro dell'Apocalisse, mentre i gigli e le rose ai suoi piedi simboleggiano purezza e amore divino.

Le figure allungate e la pennellata tremolante di El Greco distinguono la sua interpretazione dalla chiarezza serena di artisti precedenti come Murillo, le cui successive Immacolate Concezioni sarebbero diventate lo standard spagnolo. Qui, il dramma risiede nell'ascensione delle forme e nel colore intenso, quasi ultraterreno. Si sa poco sulla storia iniziale del dipinto, e il mecenate originale rimane incerto, un destino comune per le commissioni di El Greco durante il suo periodo a Toledo. È probabile che l'opera fosse destinata a una cappella privata o a una confraternita religiosa dedicata alla Vergine.

Nel corso dei secoli, il dipinto ha cambiato più volte proprietario, in un certo momento è stato attribuito erroneamente e quasi perso tra opere minori del tardo Rinascimento. Oggi, L'Immacolata Concezione con San Giovanni Evangelista è riconosciuta come un esempio chiave dello stile spagnolo precoce di El Greco, un ponte tra la sua formazione veneziana e l'arte visionaria che avrebbe creato a Toledo.