Когда Рафаэль покинул Флоренцию и отправился в Рим в 1508 году, он оставил незавершённую алтарную картину, которая стала загадкой для искусствоведов: Мадонна с балдахином. Эта картина является единственной крупной алтарной картиной с Мадонной и младенцем, которую Рафаэль начал во Флоренции, и её незавершённое состояние вызвало столетия спекуляций. Работа была заказана для капеллы семьи Деи в церкви Санто Спирито во Флоренции и была оставлена, когда Рафаэль был призван папой Юлием II — поворотный момент, который положил начало его карьере в Риме.

Позже художники, включая Фра Бартоломео, были призваны завершить или восстановить части картины, размывая границы между работой Рафаэля и других. В центре картины Мадонна сидит на троне под величественным зелёным и золотым балдахином, держа в руках младенца Христа, который с любовью смотрит на младенца Иоанна Крестителя. Святые Пётр и Бернард flanking the throne, их жесты направляют взгляд зрителя вверх. Пышная, симметричная композиция и ритмичное размещение ангелов над головой напоминают о балансе и спокойствии флорентийского периода Рафаэля, в то время как богатая архитектурная обстановка свидетельствует о влиянии его изучения Фра Бартоломео.

В отличие от более интимной Мадонны на лугу Рафаэля, здесь святые фигуры возвышены и монументальны, их присутствие усиливается архитектурной грандиозностью. После своего оставления Мадонна с балдахином осталась во Флоренции, пройдя через несколько рук и пережив вмешательства последующих художников. В 17 веке она была приобретена семьёй Медичи и установлена в Палаццо Питти, где находится и сегодня. Незавершённая нижняя часть картины и видимые изменения в исполнении сделали её отправной точкой для дебатов о методах работы Рафаэля и совместной природе ренессансных мастерских.

Как объект, она соединяет молодые эксперименты Рафаэля во Флоренции и зрелый стиль, который он разовьёт в Риме, предлагая редкий взгляд на момент перехода как для художника, так и для самого ренессансного искусства.